La seconde guerre mondiale
Saint-Cyr ferme ses portes en 1940 et est bientôt occupée par l’ennemi. Reformée à AIX-EN-PROVENCE dans le cadre de l'Armée de l’Armistice, elle continue à instruire trois promotions, côte à côte avec l’Ecole de SAINT-MAIXENT, jusqu’en novembre 1942 où l’invasion de la zone libre par l’Armée Allemande provoque sa dissolution.
La plupart des élèves rejoignent les rangs de la Résistance, certains gagnent les chantiers de jeunesse, tandis que d’autres tentent d’atteindre l’Afrique du Nord pour reprendre le combat. L’occupation complète de la métropole et la nécessité de former rapidement des officiers aptes à encadrer les Forces Françaises de la libération, exigèrent la création d’une école de formation d’officiers sur le sol Africain.
L’École de CHERCHELL vit le jour en 1942 sur la terre Algérienne et constitue alors une innovation complète, car outre son caractère interarmes, elle groupe pour la première fois des Saint-cyriens et des candidats issus des Corps de Troupe. Cette formule répond au souci primordial de créer une école de formation unique pour tous les jeunes officiers de l’Armée de Terre. Unique parce qu’elle doit assurer l’encadrement en officiers de toutes les Armes. Les réalités du champ de bataille mettent en lumière l’étroite solidarité qui lie tous les officiers, indépendamment de leur Arme. Il faut donc que les futurs chefs reçoivent à la base une même formation et un esprit interarmes. Unique encore parce qu’elle réunit dans les mêmes unités d’instruction, des candidats sortant des lycées et admis à l’École après un concours de niveau élevé et ceux, déjà Sous-officiers, qui ont acquis dans les Corps de troupe une expérience certaine du commandement et de la vie militaire.
CHERCHELL forme ainsi la majeure partie des jeunes cadres de l’armée de libération, rassemblant des vocations aussi diverses qu’affirmées : évadés de France par Londres ou l’Espagne, arrivés d’Afrique, cyrards ou anciens sous-officiers.
En 1944, l’École d’Élèves Aspirants de CHERCHELL devient l’École Militaire Interarmes. En juin et juillet 1944, les bombardements alliés qui préparent le débarquement en Normandie détruisent complètement le village et I’École de Saint-Cyr. Les reliques du Musée, les archives qui retracent l’histoire de ses 132 années d’existence sont anéanties. Au cours de la seconde guerre mondiale, Saint-Cyriens et Officiers d’origine « Corps de Troupe » avaient donné leur vie pour leur pays sur les champs de bataille de Norvège, de France, d’Afrique, d’Italie, d’Allemagne et d’Indochine. Beaucoup d’entre eux étaient tombés dans le maquis qu’ils animaient, ou avaient disparus dans l’affreux anonymat des fosses communes des camps de déportation.
Trois Saint-Cyriens furent élevés à la dignité de Maréchal de France : LECLERC, de LATTRE (à titre posthume) et JUIN.